厦门大学嘉庚学院自创办之日起就确立了“面向人才市场办学，通过市场谋求发展”的战略思路。学校据此制定了学科专业建设总体规划，明确了各个不同发展阶段学科专业建设目标，坚持以人才市场需求为导向，建立门类多元、结构合理、协调发展的学科专业体系；同时紧密跟踪交叉、应用学科专业的前沿状况，不断积极探索和稳步培育适应社会经济发展需求的新兴学科专业，努力构建与我国经济社会发展形势相适应的学科专业结构体系。如今，嘉庚学院已设置涵盖理学、工学、文学、艺术学、经济学、管理学和法学等学科门类的55个本科专业、83个专业方向，形成门类多元、结构合理、协调发展的学科专业体系，并树立了优先发展应用类学科专业，重点发展工科应用型专业，适时发展满足战略性新兴产业人才需求的学科专业，以及努力改革和发展传统学科专业、集中力量办好一流专业、在专业大类下灵活设置专业方向等鲜明的学科专业建设特色。

　　学校高度重视专业规划与内涵建设，坚持“面向人才市场，用质量打造品牌，以创新推动发展”的原则。学校鼓励各院系结合自身学科发展需要，走专业特色化发展之路，追踪学科发展新趋势，探索跨学科交叉融合，稳步推进专业内涵建设，不断深化课程体系改革，努力寻求办学资源最优配置，全面提升人才培养质量。

　　与此同时，学校以科学建构符合学校“应用型、复合型、创新型”人才培养目标定位的学科专业人才培养方案为突破口，以努力建设一支“高水平、重职责、有爱心”的教师队伍为基础，以全面落实教学改革与教学质量工程建设为抓手，以形成一批突出实践应用、专业特色鲜明的学科专业为目标，强力推进学科专业内涵建设，不断提升和优化学科专业品质，使学校的学科专业建设获得鲜活的生命力，持续健康发展。

　　值得一提的是，2014年，学校启动研究生教育，与厦门大学研究生院联合培养硕士研究生。截至2023年6月，学校共选聘研究生导师89人，招生专业19个，联合培养研究生267人。研究生教育的开展对学科专业建设起到了积极的促进作用。目前学校拥有省级应用型学科4个，省级一流专业9个。